Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms