Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms