Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPAG4Q9NPE6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms