Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMURF2Q9HAU4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms