Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms