Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
VN1R3Q9BXE9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms