Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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