Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LPIN3Q9BQK8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms