Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP9Q99956 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms