Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms