Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DCLRE1CQ96SD1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms