Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SAMD8Q96LT4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SAMD8Q96LT4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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SAMD8Q96LT4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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SAMD8Q96LT4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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SAMD8Q96LT4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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SAMD8Q96LT4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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SAMD8Q96LT4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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SAMD8Q96LT4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SAMD8Q96LT4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD8Q96LT4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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