Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms