Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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