Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM71DQ8N9W8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM71DQ8N9W8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM71DQ8N9W8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM71DQ8N9W8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM71DQ8N9W8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM71DQ8N9W8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM71DQ8N9W8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM71DQ8N9W8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM71DQ8N9W8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FAM71DQ8N9W8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FAM71DQ8N9W8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FAM71DQ8N9W8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FAM71DQ8N9W8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FAM71DQ8N9W8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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FAM71DQ8N9W8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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FAM71DQ8N9W8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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FAM71DQ8N9W8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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FAM71DQ8N9W8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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FAM71DQ8N9W8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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FAM71DQ8N9W8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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