Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX29P2Q8IUI4 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms