Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HAPLN4Q86UW8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms