Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SYNE3Q6ZMZ3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYNE3Q6ZMZ3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms