Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms