Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms