Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NANOGP8Q6NSW7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms