Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP9Q5VTM2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms