Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms