Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms