Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms