Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms