Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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