Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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