Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRRQ15256 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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PTPRRQ15256 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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