Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CDK5R1Q15078 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CDK5R1Q15078 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDK5R1Q15078 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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