Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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