Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL19A1Q14993 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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