Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDK13Q14004 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
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