Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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IFT88Q13099 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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IFT88Q13099 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
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IFT88Q13099 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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IFT88Q13099 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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IFT88Q13099 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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IFT88Q13099 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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