Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSTF3Q12996 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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