Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
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