Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms