Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELP6Q0PNE2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELP6Q0PNE2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELP6Q0PNE2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELP6Q0PNE2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELP6Q0PNE2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELP6Q0PNE2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELP6Q0PNE2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELP6Q0PNE2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ELP6Q0PNE2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ELP6Q0PNE2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ELP6Q0PNE2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ELP6Q0PNE2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms