Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNDQ07001 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNDQ07001 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms