Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms