Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms