Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ARID5AQ03989 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARID5AQ03989 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms