Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAV1Q03135 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms