Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms