Protein–RNA interactions for Protein: Q00013

MPP1, 55 kDa erythrocyte membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPP1Q00013 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MPP1Q00013 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms