Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTA1P68133 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms