Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VBP1P61758 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms