Protein–RNA interactions for Protein: P61026

RAB10, Ras-related protein Rab-10, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB10P61026 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB10P61026 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB10P61026 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB10P61026 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB10P61026 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB10P61026 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB10P61026 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB10P61026 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB10P61026 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB10P61026 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB10P61026 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB10P61026 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB10P61026 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB10P61026 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB10P61026 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB10P61026 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB10P61026 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB10P61026 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB10P61026 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB10P61026 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB10P61026 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB10P61026 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB10P61026 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB10P61026 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB10P61026 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB10P61026 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB10P61026 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB10P61026 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB10P61026 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB10P61026 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB10P61026 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB10P61026 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB10P61026 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB10P61026 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB10P61026 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB10P61026 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB10P61026 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB10P61026 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB10P61026 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB10P61026 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB10P61026 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB10P61026 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB10P61026 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB10P61026 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms