Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL3P58215 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms