Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME5P56597 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME5P56597 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms